El costo del transporte público se ha convertido en el centro de una fuerte disputa política entre el partido Movimiento Ciudadano (MC) y el Partido Revolucionario Institucional (PRI) en el estado; Mientras el gobierno actual defiende el ajuste basándose en la modernización del sistema, la oposición califica la medida como un «asalto al bolsillo» de los ciudadanos.
A través de un comunicado oficial, el PRI Jalisco denunció que el pasaje subirá de $9.50 a $14.00 pesos, lo que representa un incremento cercano al 50%. La dirigencia priista sostiene que este aumento afectará desproporcionadamente a quienes perciben un salario mínimo, quienes podrían destinar más de una cuarta parte de sus ingresos solo a traslados.
Entre sus principales críticas destacan:
Insuficiencia del subsidio: Señalan que solo se entregarán 1.5 millones de tarjetas subsidiadas para un universo de 3 millones de usuarios, dejando a la mitad de la población sin apoyo.
Cuestionamiento a la infraestructura: Afirman que la Línea 4 del Tren Ligero presenta fallas de planeación y ha generado una deuda superior a los 21 mil 500 millones de pesos que se pagará hasta el año 2060.
Calidad del servicio: Acusan que el sistema sigue siendo «ineficiente, insuficiente y peligroso», y que el bono de 1,200 millones de pesos destinado a transportistas no exige una mejora real en el servicio.

Por su parte, Movimiento Ciudadano Jalisco respondió calificando la postura del PRI como «incongruente». El partido en el gobierno argumenta que, incluso con los ajustes, la tarifa en Jalisco se mantiene por debajo de la media nacional y se posiciona entre las más bajas del país. Sus argumentos centrales para defender la política de movilidad son:
Subsidio directo: El Gobierno de Jalisco aplica un subsidio de 3 pesos por viaje para proteger la economía familiar.
Inversión en tecnología: Destacan la entrega de 200 unidades 100% eléctricas, la renovación de vagones en las Líneas 1 y 2, y la puesta en marcha de la Línea 4, además de los avances en la conexión hacia el aeropuerto (Línea 5).
Antecedentes políticos: MC recordó que fue durante la administración estatal del PRI (2018) cuando se dio un «tarifazo» que dejó el sistema en condiciones precarias y obras inconclusas.

Ambas fuerzas políticas se atribuyen la creación y fortalecimiento de programas como MiBici y la expansión del Tren Ligero. Mientras el PRI asegura que durante sus gobiernos se sentaron las bases de la infraestructura actual y programas de apoyo estudiantil (Bienevales), Movimiento Ciudadano sostiene que bajo su gestión se ha logrado una movilidad «más humana» y eficiente.
La controversia permanece abierta mientras los usuarios del Área Metropolitana de Guadalajara comienzan a experimentar el impacto de las nuevas tarifas y la implementación de los apoyos gubernamentales esto tras la sesión del Comité Técnico Tarifario a finales de diciembre de 2025, donde se determinó que la tarifa técnica (el costo real de operación) es de $14.00 pesos, sin embargo, el Gobierno del Estado, anunció que esta no se trasladará íntegramente al usuario.
Se dijo que el gobierno destinará una bolsa de 1,200 millones de pesos para cubrir $3.00 pesos de cada pasaje, además quienes utilicen la nueva «Tarjeta Única Al Estilo Jalisco» pagarán $11.00 pesos. Así mismo a partir del 1 de abril de 2026, el pago en efectivo será de $14.00 pesos de forma generalizada, lo que el PRI ha calificado como un golpe directo a quienes no tienen acceso a medios de pago electrónicos.

El gobierno ha aclarado que no hay un límite de tarjetas para los 8.5 millones de jaliscienses. El proceso clave para los usuarios es el siguiente:
12 de enero de 2026: Inicia el prerregistro en línea para la Tarjeta Única.
19 de enero de 2026: Comienza la entrega física de los plásticos.
1 de abril de 2026: Entrada en vigor oficial de la tarifa de $11.00 (con tarjeta) y $14.00 (efectivo).
La situación de la infraestructura es otro punto de fricción. El PRI ha anunciado recorridos de vigilancia para identificar fallas en la Línea 4 del Tren Ligero, la cual comenzó a operar comercialmente el 1 de enero de 2026 tras un periodo de pruebas gratuitas. La oposición sostiene que la obra carece de planeación y dejó una deuda masiva.

Por el contrario, MC defiende que la red se encuentra en su mayor expansión histórica, destacando que la Línea 4 ya transportó a más de 360 mil pasajeros en su semana de pre-operación y que los proyectos para la Línea 5 (que conectará con el Aeropuerto) avanzan para consolidar el sistema interconectado.
El PRI Jalisco, a través de su dirigencia, ha solicitado formalmente el veto del aumento y ha llamado a comparecer a los titulares de Transporte y Hacienda. Denuncian un posible «uso electorero» de la entrega de tarjetas y exigen transparencia en la partida presupuestal de los 1,200 millones de pesos.
MC responde señalando que la administración actual ha reducido un 21% las muertes vinculadas al transporte público durante 2025 y que el subsidio ya no se entrega a los transportistas (como se hacía en gobiernos priistas), sino directamente al bolsillo del ciudadano mediante la tecnología de prepago.